Sesión 2.1

Organización, recomendaciones y buenas prácticas reproducibles

Los resultados de aprendizaje de la sesión…

Los contenidos de la sesión…

Actividades y materiales

[Tiempo estimado: 4 horas]

Existen excelentes guías practicas con recomendaciones generales para el fomento de la reproducibilidad, gestión de datos de investigación y la ciencia abierta. En esta semana echaremos un vistazo a tres guías que son recursos excelentes para la ciencia abierta y la investigación reproducible.

  1. La British Ecological Society publica breves guías para la realización de ciencia abierta. Lee la guía Reproducible code (Cooper and Hsing 2019), que explica aspectos organizativos centrados en la ecología pero aplicables a cualquier disciplina.

  2. Lee Passport for Open Science: A Practical Guide for PhD Students (Baker and Larrouturou 2020), explica cómo elaborar la investigación doctoral en línea con los principios de la ciencia abierta. Las prácticas son aplicables a cualquier disciplina y, aunque centradas en estudiantes de doctorado, se dirigen a cualquier investigador/a con independencia de su experiencia previa.

  3. Esta presentación “Basic recommendations for reproducible projects” (slides) (y video) resume algunos de los aspectos y prácticas de tipo organizativo para la preparación y primeros pasos de un proyecto. Según los tres aspectos a mejorar (limitaciones) que identificaste en la sesión anterior, reflexiona y selecciona las prácticas que puedes llevar a cabo para superar dichas limitaciones en tu próximo artículo de investigación.

  4. The Turing Way es el tercer recurso o guía de esta sesión. Se trata mas bien de un compendio de guías sobre la ciencia abierta, reproducibilidad y la ética en la investigación. Lee la sección de “Licensing” de la Guide for Reproducible Research (The Turing Way Community et al. 2019).

  5. En la segunda sesión online de Tutorías (21 Abril) resumiremos el ecosistema de licencias para datos y software, y las enmarcaremos en la reciente Declaración institucional a favor de la promoción del acceso abierto en la Universitat Jaume I (Octubre 2020). Comenta sobre el tipo de licencia para software y para datos que utilizas normalmente (si lo haces), y cuál utilizarías en el caso de que nunca hayas especificado una licencia.

  6. Lee las dos primeras secciones (Software Citation Principles, Motivation) del artículo Software citation principles (Smith, Katz, and Niemeyer 2016). Luego, salta al Anexo B (Software citation use cases), que enumera situaciones de uso de software que se pueden dar en un artículo. ¿Qué casos de usos (selecciona 3 como máximo) se dan habitualmente en tus artículos? De estos, ¿en cuantos de ellos citas el software correctamente?.

Entrega

Baker, Anne-Sophie, and Bernard Larrouturou. 2020. “Passport for Open Science.” University of Lille. https://www.ouvrirlascience.fr/passport-for-open-science-a-practical-guide-for-phd-students/.
Cooper, Natalie, and Pen-Yuah Hsing. 2019. “Reproducible Code.” British Ecological Society. https://www.britishecologicalsociety.org/publications/guides-to/.
Smith, AM, DS Katz, and KE Niemeyer. 2016. “Software Citation Principles.” PeerJ Computer Science 2: e86. https://doi.org/10.7717/peerj-cs.86.
The Turing Way Community, Becky Arnold, Louise Bowler, Sarah Gibson, Patricia Herterich, Rosie Higman, Anna Krystalli, et al. 2019. “The Turing Way: A Handbook for Reproducible Data Science,” March. https://doi.org/10.5281/zenodo.3233986.

References

Reuse

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