Sesión 3.2

Notebooks con R Markdown

Los resultados de aprendizaje de la sesión…

• RRP09 - Aplicar notebooks para la documentación de análisis computacionales.
• RRP10 - Diseñar y crear notebooks para la creación de artículos científicos, informes técnicos o presentaciones.

Los contenidos de la sesión…

• Notebook integra de narrativa (preguntas, texto) y código (análisis, resultados)

• Contextualización de usos de Markdown en nuestra investigación/docencia

Actividades y materiales

[Tiempo estimado: 2 horas]

1. El siguiente video “What is R Markdown?” proporciona en algo más de un minuto lo que es R Markdown, es decir, un documento Markdown al cual se añade código en R (u otro lenguaje de programación) y genera un documento integrado como resultado.

2. En esta demo, podéis ver un ejemplo de estructura y organización de un notebook en R Markdown.

3. Este vídeo muestra un ejemplo de un artículo reproducible (Miralles et al. 2020), que os puede servir de guía para que vuestro próximo artículo sea mucho más reproducible.

4. Realiza un reflexión final sobre qué aspectos quieres intentar para que tu próximo artículo sea (un poco más) reproducible. ¿Si estás con tu tesis doctoral, ¿qué aspectos y practicas del curso crees que puedes adaptar de forma inmediata? Si tu perfil es más docente, ¿qué ideas (markdown, notebooks, etc) podrías aplicar a tu docencia?

Entrega

• Sube tu reflexión final (Actividad 4) en el foro ¿qué puedo hacer para que mi próximo artículo sea más reproducible en el AV.